Les prix co-portés par l'AFFI sont au nombre de trois. Le premier, en partenariat avec NYSE Euronext, récompense chaque année une thèse dont le sujet traite de finance de marché. Le second, enpartenariat avec la FNEGE, récompense une thèse de finance d'entreprise. Enfin, le prix Finance distingue chaque année un article publié dans la revue Finance.